Геномное отслеживание показывает рост и падение COVID-19 в провинции Гуандун

Новое исследование, проведенное исследователями из Оксфордского и Гуандунского центра по контролю и профилактике заболеваний, описывает эпидемиологическую и генетическую структуру вспышки COVID-19 в самом густонаселенном регионе Китая и показывает, как раннее и интенсивное тестирование и отслеживание помогли прервать местную передачу вируса.

В исследовании сочетается секвенирование генома и эпидемиология, чтобы выявить три фазы вспышки в провинции Гуандун, Китай, в январе и феврале этого года: появление новых случаев заболевания в провинции Гуандун из других провинций Китая, рост и падение местной передачи в пределах провинции Гуандун, и наконец импорт новых случаев в Гуандун от международных путешественников. Эпидемия в Гуандуне была второй по величине в Китае, за исключением Хубэй, где находится Ухань.

В провинции Гуандун, где проживает более 100 миллионов человек, тестирование было проведено быстро. К 19 марта в общей сложности 1,6 миллиона тестов на COVID-19 выявили 1388 положительных случаев. В конце января началось усиленное наблюдение, целью которого было наблюдение за всеми путешественниками, возвращающимися из Хубэй и другими провинциями, которые испытывают вспышки, их близкие контакты и все госпитализированные пациенты в клиниках, даже если у них не было симптомов и не было никакого известного контакта с инфицированными людьми.

Анализируя геномы, полученные от инфицированных людей, исследователи устанавливают, что вспышка в провинции Гуандун не была вызвана одной большой цепью передачи, но вместо этого были сотни независимых интродукций из-за пределов провинции. Локально передаваемые цепи инфекции показаны их генетической информацией как ограниченные по размеру и продолжительности. Это, по словам исследователей, свидетельствует о том, что скрининг и вмешательства, проводимые в провинции Гуандун, были эффективными при прерывании локальной передачи вируса .

Исследование также показывает, что геном SARS-CoV-2 (вирус, который вызывает COVID-19) может быть быстро секвенирован и проанализирован почти в реальном времени. Из-за скорости и характера этой вспышки были предприняты разные экспериментальные подходы. Хорошие результаты были получены с использованием портативного устройства для секвенирования MinION (разработанного Oxford Nanopore Technologies) и протокола секвенирования, разработанного сетью ARTIC.

Читайте по теме:  Храм великомученицы Татьяны

Авторы уверены, что этот подход к изучению ранней эпидемии COVID-19 в Китае может быть расширен и применен к другим вспышкам COVID-19 во всем мире.

Старший автор профессор Оливер Пибус из факультета зоологии и Оксфордской школы Мартина и другие авторы в настоящее время являются ключевыми членами британского консорциума COVID-19 Genomics. Этот консорциум уже секвенировал> 3000 геномов из Великобритании и проанализировал их, чтобы отследить передачу и понять, как развивается вирус.

Профессор Оливер Пибус говорит: «Мы уже знаем, что изменения в геноме COVID-19 накапливаются медленнее, чем у других вирусов, таких как грипп. Это означает, что вирус COVID-19 движется и передает быстрее, чем мутирует. Поэтому очень важно проанализировать геномы вируса в сочетании с подробной эпидемиологической информацией, чего мы добились в этом исследовании ».

В дальнейшем эти геномные данные будут использоваться не только для понимания того, как вирус распространяется по местам, но и для отслеживания различных генетических вариаций вируса , знаний, которые имеют жизненно важное значение для исследователей, работающих над вакцинами и антивирусными препаратами.

Доктор Цзин Лу из Института общественного здравоохранения провинции Гуандун, Центр контроля заболеваний провинции Гуандун, говорит: «Чтобы получить лучшее и наиболее эффективное понимание, нам необходимо объединить информацию о геноме вируса с эпидемиологией и другими данными. Наша работа в провинции Гуандун показывает, что Высокие уровни очень раннего тестирования, наряду с активным отслеживанием случаев и строгой изоляцией, могут поставить под контроль вспышку ».

Понравилась статья? Поделиться с друзьями:
Варикоз: симптомы, лечение и профилактика заболевания
Добавить комментарий

;-) :| :x :twisted: :smile: :shock: :sad: :roll: :razz: :oops: :o :mrgreen: :lol: :idea: :grin: :evil: :cry: :cool: :arrow: :???: :?: :!:

Adblock
detector